Η πρώτη πτήση στην Ινδονησία πραγματοποιήθηκε το 1924 από τον Knilm από το Bandung στη Batavia.
Η Garuda Indonesia ιδρύθηκε το 1949 και είναι μια εθνική αεροπορική εταιρεία της Ινδονησίας.
Η Ινδονησία έχει περισσότερες από 100 αεροπορικές εταιρείες, συμπεριλαμβανομένων των ενοικιαζόμενων αεροπορικών εταιρειών και των αεροπορικών εταιρειών φορτίου.
Το αεροσκάφος Batik Air έχει τυπικό σχεδιασμό ινδονησιακού Batik στην ουρά του αεροσκάφους.
Το αεροδρόμιο Soekarno-Hatta στη Τζακάρτα είναι το πιο πολυσύχναστο αεροδρόμιο της Ινδονησίας και επεξεργάζεται πάνω από 60 εκατομμύρια επιβάτες κάθε χρόνο.
Η Citilink Indonesia είναι μια αεροπορική εταιρεία χαμηλού κόστους που ανήκει στην Garuda Indonesia.
Η Ινδονησία AirAsia είναι μια αεροπορική εταιρεία χαμηλού κόστους που ανήκει στον όμιλο AirAsia.
Το Wings Air είναι μια περιφερειακή αεροπορική εταιρεία που ανήκει στην Lion Air Group.
Οι ινδονησιακές αεροπορικές εταιρείες εξυπηρετούν ινδονησιακές σπεσιαλιτέ όπως το τηγανητό ρύζι και το Satay σε πτήσεις μακράς διαχωρισμού.
Η Ινδονησία διαθέτει πολλά αεροδρόμια που βρίσκονται σε απομακρυσμένες περιοχές και είναι δύσκολο να επιτευχθούν, όπως το αεροδρόμιο Wamena στην Παπούα.