El primer experto genético de Indonesia es el profesor. Dr. Koentjaraningrat, conocido como el padre de la sociología indonesia.
La investigación genética en Indonesia comenzó en 1928 por el Dr. J.C. Koningsberger, un botánico holandés.
La investigación genética en Indonesia se desarrolló rápidamente en las décadas de 1950 y 1960 con el descubrimiento del primer cromosoma humano en Indonesia por el Prof. Dr. S. Sudjadi.
El desarrollo de la tecnología de huellas dactilares de ADN en Indonesia fue precedido por el Prof. Dr. Widodo Judarwanto en la década de 1990.
En 2007, Indonesia logró recolectar ADN de toda la población indonesia a través del Proyecto del Genoma Nusantara.
Los estudios genéticos en animales indonesios muestran que la presencia de especies endémicas solo se encuentra en Indonesia, como los tigres javaneses y los orangutanes de Sumatra.
Algunos estudios genéticos en Indonesia también están relacionados con la salud, como el estudio de factores genéticos que afectan el riesgo de desarrollar diabetes y cáncer de mama.
Indonesia tiene recursos genéticos ricos, como las plantas medicinales tradicionales, que pueden usarse para el desarrollo de nuevos medicamentos.
Algunos estudios genéticos en Indonesia también muestran diferencias genéticas entre los diferentes grupos étnicos en Indonesia.
En la actualidad, Indonesia tiene una serie de expertos genéticos líderes en el mundo, como el Prof. Dr. Herawati Sudoyo, quien ha contribuido mucho a la investigación genética en Indonesia.
