Prvi novčić u Indoneziji uvelo je kraljevstvo Srivijaya u 7. stoljeću AD.
Prvi papirni novac u Indoneziji tiskala je 1811. godine nizozemska Istočna Indija.
Tijekom administracije predsjednika Soekarna, rupija je zamijenjena novom valutom nazvanom Nova rupija 1965. godine.
Godine 1998. Indonezija je doživjela monetarnu krizu koja je uzrokovala da se vrijednost rupija dramatično smanji u odnosu na dolar Sjedinjenih Država.
100.000 novčanica Rupiah, koje je prvi put objavljeno 1999. godine, ima sliku Nacionalnog heroja Cut Nyak Dien.
Godine 2016. Banka Indonezija izdala je nove novčanice i metale s temom indonezijske raznolikosti.
Novac RP 1 novčića je ispisano aluminijem iako bi trebao koristiti bakreni materijal.
U 2011. godini Banka Indonezija izdala je nove bankote sa 100 000 denominacija Rupiaha koje imaju sofisticiranije sigurnosne značajke.
Tijekom nizozemskog kolonijalnog razdoblja, tiskani papirni novac imao je sliku Ratu Wilhelmina.
Tijekom administracije predsjednika Jokowi, Bank Indonesia izdala je novčanice sa slikama nacionalnih junaka kao što su Soekarno, Hatta i Kartini.