Indonézia je domovom viac ako 3 000 druhov rýb vrátane žralokov a slávnych lúčov.
Raja Ampat Islands v Západnej Papue majú viac ako 1 500 druhov rýb a 600 druhov koralov.
Indonézske koralové útesy sú druhým najväčším na svete po Veľkom bariérovom útede v Austrálii.
Chránené zelené morské korytnačky žijú v indonézskych vodách a môžu dorásť až 1 meter.
Existuje viac ako 20 typov delfínov a veľryní, ktoré sa nachádzajú v indonézskych vodách.
Indonézske koralové útesy produkujú každý rok najmenej 15 miliónov ton rýb.
Klaunské ryby, ktoré sú hlavnou postavou vo filme Finding Nemo, sú druhom pôvodných indonézskych rýb.
Indonézske vody sú tiež známe svojimi skvelými a krásnymi manta Ray.
Existuje viac ako 70 druhov medúzy, ktoré sa nachádzajú v indonézskych vodách.
Indonézia má niektoré z najlepších potápačských miest na svete, vrátane Národného parku Bunaken v North Sulawesi a národného parku Komodo vo východnej Nusa Tenggara.
