13-asrda Fermerlar qishloq xo'jaligi mahsulotlari sifatini oshirish uchun fermentatsion texnologiyalardan foydalanishgan.
70-yillarda Indoneziya zamonaviy biologiya biologiyasi va litsi biotexnologiya ilmiy markazlari kabi ilmiy-tadqiqot markazlarini tashkil etish orqali zamonaviy biotexnologiyani rivojlantira boshladi.
Indoneziya biotexnologik yutuqlarining eng taniqli natijalaridan biri 1980-yillarda shaka axlat chiqindilaridan Bioetanol ishlab chiqarishdir.
90-yillarda Indoneziya Janubi-Sharqiy Osiyoda birinchi GMO zavodini, ya'ni zararkunandalarga chidamli makkajo'xori rivojlantirdi.
2000 yillarda indoneziyalik biotexnologiya vaktsinalar rivojiga, shu jumladan qush gripp vaktsinalar, shu jumladan qush gripp vaktsinalarida.
Shuningdek, Indoneziya, shuningdek, ekologik ifloslanishni kamaytirishi mumkin bo'lgan to'qimachilik bakteriyalaridan foydalangan holda chiqindilarni tozalash texnologiyasini ishlab chiqdi.
2016 yilda Indoneziya diabetni davolash uchun foydali bo'lgan Janubi-Sharqiy Osiyoda birinchi rekombinant insulin ishlab chiqarishga muvaffaq bo'ldi.
Indoneziya ham interferon va eritropoetin kabi bir nechta biotexnologik dorilarni ishlab chiqardi.
Indoneziya biotexnologiya tadqiqotlarini ishlab chiqishda, shuningdek biogaz va biodizel ishlab chiqarish texnologiyasini ishlab chiqish orqali indoneziyalik biotexnologiya tadqiqotlarining diqqat markaziga aylandi.
Indoneziya hukumati biotexnologiya sohasi milliy biotexnologiya milliy biotexnologiyasi milliy savodxonligi va ilmiy markazlar va biotexnologiya biznes inkubatorlarini rivojlantirish kabi dasturlarni kuchaytirishda davom etmoqda.
