Bộ phim hoạt hình đầu tiên ở Indonesia là Tjonat vào năm 1957.
Lần đầu tiên sản xuất hoạt hình ở Indonesia được thực hiện bởi hãng phim nhà nước.
Hoạt hình đầu tiên được sản xuất bởi hãng phim nhà nước là Sangkuriang vào năm 1959.
Một trong những phim hoạt hình nổi tiếng nhất ở Indonesia là Doraemon bắt đầu được phát sóng vào năm 1990.
Vào năm 2007, Indonesia đã giành được giải thưởng hoạt hình hay nhất tại Liên hoan phim hoạt hình quốc tế tại Annecy, Pháp.
Một trong những nhà làm phim hoạt hình nổi tiếng của Indonesia là Riri Riza, người đã giành được giải thưởng hoạt hình hay nhất tại Liên hoan phim Cannes năm 2002.
Năm 2017, bộ phim hoạt hình của Sultan Agung: Throne, Struth, Love đã trở thành một bộ phim hoạt hình Indonesia với thu nhập cao nhất mọi thời đại.
Vào năm 2020, Indonesia đã phát hành bộ phim hoạt hình đầu tiên về huyền thoại bóng đá Indonesia, Kampung Bola: The Movie.
Có một số hãng phim hoạt hình nổi tiếng ở Indonesia, bao gồm The Animation Studio of Prodigy và Base Entertainment.
Indonesia có một cộng đồng hoạt hình tích cực và sáng tạo, chẳng hạn như cộng đồng hoạt hình Indonesia (KAI) và Motion Plus Indonesia Design (MPDI).