Vào những năm 1980, Indonesia chưa có các quy định chính thức về an ninh mạng, vì vậy nhiều công ty và tổ chức dễ bị tấn công mạng.
Vào những năm 1990, chính phủ Indonesia bắt đầu đưa ra luật về an ninh mạng, bao gồm cả Luật số 11 năm 1992 liên quan đến các hệ thống điện tử và giao dịch điện tử.
Vào những năm 2000, Indonesia là mục tiêu của các cuộc tấn công mạng ngày càng thường xuyên, bao gồm các cuộc tấn công vào các trang web của chính phủ và công ty.
Năm 2011, Indonesia đã trải qua vụ tấn công mạng lớn nhất trong lịch sử, khi một nhóm tin tặc được gọi là Indonesia ẩn danh đã tấn công trang web của chính phủ.
Vào năm 2013, chính phủ Indonesia đã công bố thành lập Cơ quan mật khẩu Siber và Nhà nước (BSSN) để cải thiện an ninh mạng ở Indonesia.
Vào năm 2014, một công ty bảo mật Siber Indonesia có tên Xynexis đã thành công trong việc hack trang web ISIS, khiến công ty nổi tiếng trên toàn thế giới.
Năm 2016, Indonesia đã tổ chức Hội nghị cấp cao ASEAN về an ninh mạng, đã thảo luận về các vấn đề an ninh mạng ở khu vực Đông Nam Á.
Năm 2017, Indonesia đã ra mắt nhóm ứng phó sự cố bảo mật Indonesia về chương trình Cơ sở hạ tầng Internet (ID-SIRTII) để tăng cường an ninh mạng ở Indonesia.
Năm 2018, chính phủ Indonesia đã đưa ra luật an ninh mạng để bảo vệ cơ sở hạ tầng quan trọng và ngăn chặn các cuộc tấn công mạng.
Năm 2019, Indonesia trở thành một trong những quốc gia đầu tiên trên thế giới đưa ra chiến lược an ninh mạng quốc gia, nhằm mục đích cải thiện an ninh mạng trên khắp Indonesia.