Keemia on üks subjekte, keda õpetatakse Indoneesia koolides alates Hollandi koloniaaliajastust.
Indoneesias on palju keemiaga seotud loodusvarasid, näiteks nafta, maagaas ja tinakaevandused.
2019. aastal korraldas Indoneesia 47. rahvusvahelise keemiakonverentsi, kus osalesid tuhanded teadlased kogu maailmast.
Indoneesias on mitu ülikooli, kus on parimad keemia peamised peamised ettevõtted, näiteks Indoneesia ülikool ja Bandungi tehnoloogiainstituut.
Üks kuulsaid Indoneesia keemiateadlasi on prof. Dr. Djoko Santoso, kes on saanud palju rahvusvahelisi auhindu oma uurimistöö eest orgaanilise keemia valdkonnas.
Indoneesias on ka mõned Aasia suurimad keemiaettevõtted, näiteks PT Chandra Asri Petrokeemia TBK ja PT Pupuk Indonesia.
Aastal 2013 õnnestus Gadjah Mada ülikooli uurimisrühmal arendada mangosteenivardast valmistatud akusid, mis on keskkonnasõbralikum ja odavam kui tavalised akud.
Üks kuulsatest traditsioonilistest Indoneesia relvadest Keris, mis kasutas keerulist keemiatehnikat tugevate ja teravate materjalide loomiseks.
2015. aastal sai Indoneesiast üks esimesi riike maailmas, millel õnnestus toota turbajäätmeid.
Indoneesias on ka mõned ainulaadsed keemilised uuendused, näiteks palmiõli seep ning Mangosteen Peel ja Teak Lehtede looduslikud värvained.