Chémia je jedným z predmetov vyučovaných na školách v Indonézii od holandskej koloniálnej éry.
Indonézia má veľa prírodných zdrojov týkajúcich sa chémie, ako je ropa, zemný plyn a plechové bane.
V roku 2019 hostila Indonézia 47. medzinárodnú konferenciu o chémii, na ktorej sa zúčastnili tisíce vedcov z celého sveta.
V Indonézii existuje niekoľko univerzít, ktoré majú najlepšie veľké chémie na svete, ako napríklad Indonézia University a Bandung Institute of Technology.
Jedným zo slávnych indonézskych vedcov chémie je Prof. DR. Djoko Santoso, ktorý získal mnoho medzinárodných ocenení za svoj výskum v oblasti organickej chémie.
Indonézia má tiež niektoré z najväčších chemických spoločností v Ázii, ako napríklad PT Chandra Asri Petrochemical TBK a PT Pupuk Indonézia.
V roku 2013 sa výskumnému tímu z univerzity Gadjah Mada podarilo vyvíjať batérie vyrobené z Mangosteen Rod, ktorá je ekologickejšia a lacnejšia ako konvenčné batérie.
Jedna zo známych tradičných indonézskych zbraní, Keris, vyrobená z komplikovaného chemického inžinierstva na vytvorenie silných a ostrých materiálov.
V roku 2015 sa Indonézia stala jednou z prvých krajín sveta, ktorá sa podarilo vyrábať biopalivá z odpadu z rašeliny.
Indonézia má tiež niektoré jedinečné chemické inovácie, ako napríklad mydlo z palmového oleja a prírodné farbivá z Mangosteen Peel a Teak Lists.