Jalkapallo on Indonesian suosituin joukkueurheilu, ja sitä kutsutaan ihmisten urheiluun.
Indonesian kansallinen jalkapallojoukkue, joka tunnetaan nimellä Garuda, voitti kultaa vuoden 1991 meripelissä ja vuoden 2002 Tiger Cupissa.
Sulkapallo on joukkueurheilu, joka on myös erittäin suosittu Indonesiassa, ja Indonesian kansallinen sulkapallojoukkue on voittanut monia kultamitalia olympia- ja maailmanmestaruuskisoissa.
Indonesian miesten ja naisten lentopallojoukkue on myös erittäin saavuttajia kansainvälisellä tasolla voittamalla kultamitalin SEA -peleissä ja Aasian mestaruuskilpailuissa.
Perinteinen indonesialainen urheilu, jalkapallo Takraw, pelasi myös joukkueena ja hänellä on monia faneja koko maassa.
Indonesian futsalin maajoukkue on osallistunut useisiin maailman futsal -mestaruuskilpailuihin.
Vesiurheilu, kuten uinti, vesipolo ja sukellus, pelataan myös Indonesian joukkueessa, jolla on hyvä saavutus alueellisella ja kansainvälisellä tasolla.
Indonesian miesten koripallojoukkue on osallistunut useisiin Aasian koripallon mestaruuskilpailuihin ja SEA -peleihin, kun taas Indonesian naisten koripallojoukkue voitti hopeamitalin vuoden 2019 meripelissä.
Muita suosittuja joukkueurheilua Indonesiassa ovat kenttäkiekko, rugby ja kriketti.
