Prva valuta u Indoneziji je jedan od strane zakona koje je 1815. godine izdala nizozemska vlada Istočne Indije.
Tijekom japanskog kolonijalnog razdoblja, u Indoneziji su u Indoneziji uvedene novčanice s denominacijama SEN -a.
1950. rupija je postala službena valuta Indonezije nakon što je tijekom razdoblja neovisnosti upotrijebila kao zamjenska valuta.
Za vrijeme vladavine Soekarno, izdana je papirnati novac s vrlo velikim denominacijama, što je bilo 100.000 rupija.
Godine 1998. u Indoneziji je postojala monetarna kriza koja je drastično učinila vrijednost rupije, sve dok nije dosegla 17.000 rupija po američkom dolaru.
Godine 2016. Bank Indonesia izdala je nove bankote sa slikama nacionalnih junaka, poput Soekarno, Hatta i Kartini.
Godine 2020. Bank Indonesia izdala je nove novčanice sa slikama indonezijske flore i faune, poput raflesijskih cvjetova i ptica raja.
Tijekom kraljevske ere, vrijedni predmeti poput zlata, srebra i dragulja korišteni su i kao medij razmjene.
Prije papirnog novca, ljudi u Indoneziji koristili su barter sustav za provođenje trgovinskih transakcija.
U davnim vremenima, kovanice s jedinstvenim oblicima, poput novca kovanica s središnjim rupama, korišteni su kao medij razmjene u Indoneziji.