Hakera pirmo reizi parādījās Indonēzijā astoņdesmitajos gados, kad cilvēki sāka nelegāli piekļūt datoriem un mēģināja iekļūt drošības sistēmā.
Deviņdesmitajos gados Indonēzijai sāka darboties aktīva hakeru kopiena, piemēram, Indonēzijas Siber Network (JSI) un Indonēzijas atpakaļceļu komanda.
2000. gados Indonēzijā bija vairāki masīvas uzlaušanas gadījumi, piemēram, valdības vietņu uzlaušanas gadījumi un lielas korporācijas.
Daži slaveni Indonēzijas hakeri ir Agung Prabowo, Yohanes Surya un Benny Handoko.
2013. gadā Indonēzija rīkoja Starptautisko hakeru konferenci Hack-in-the-Box.
2014. gadā bija lielākais uzlaušanas gadījums Indonēzijas vēsturē, kad tika uzlauzts Veselības ministrijas vietne un tika nozagti miljoniem cilvēku personas dati.
Līdztekus tehnoloģiju attīstībai Indonēzijas hakeri ir arvien prasmīgāki un izsmalcinātāki kiberuzbrukumu veikšanā.
Pašlaik Indonēzijas valdībai ir Siber un Valsts paroļu aģentūra (BSSN), kurai ir uzdots aizsargāt valsts kiberdrošību no hakeru uzbrukumiem.
Lai arī drošības sistēmas nelikumīga uzlaušana un sabojāšana ir noziedzīgs darbība, kuru aizliedz likums, uzlaušanu var izmantot arī tādiem pozitīviem mērķiem kā sistēmas drošības pārbaude un drošības nepilnību atklāšana, kuras var uzlabot.