Infekcijas slimības var ļoti ātri izplatīties Indonēzijā salu un blīvu iedzīvotāju dēļ.
Indonēzijas vēsture reģistrē vairākus lielus uzliesmojumus, piemēram, holēru, putnu gripu un SARS.
Malārija joprojām ir viena no visbiežāk sastopamajām infekcijas slimībām Indonēzijā.
Indonēzijā ir vairākas odu sugas, kas var pārraidīt tādas slimības kā malārija, tropu drudzis, Chikungunya un Zika.
Korona vai COVID-19 vīruss pirmo reizi tika atklāts Indonēzijā 2020. gada martā, un kopš tā laika tas ir izplatījies visā valstī.
Indonēzijai ir arī unikālas infekcijas slimības, piemēram, leptospiroze, kas izplatās caur peles urīnu.
Imunizācijas programmai Indonēzijā ir izdevies samazināt mirstības līmeni infekcijas slimību, piemēram, poliomielīta un masalu, dēļ.
Indonēzija piedzīvo arī meningīta gadījumus, ko izraisa baktērijas vai vīrusi, kas uzbrūk smadzeņu membrānai un muguras smadzenēm.
Pēdējos gados trakumsērgas gadījumi ir atrodami Indonēzijā, ko izraisa dzīvnieku kodumi, piemēram, suņi un kaķi.
Lielāko daļu infekcijas slimību Indonēzijā var novērst, saglabājot tīrību, izvairoties no saskares ar savvaļas dzīvniekiem un iegūstot pareizu vakcināciju.