Evolusi adalah teori saintifik yang menerangkan bagaimana organisma di bumi berkembang dari masa ke masa.
Di Indonesia, terdapat banyak spesies endemik yang hanya terdapat di Indonesia, seperti orang utan, naga, dan bunga rafflesia.
Fosil manusia kuno pertama yang terdapat di Indonesia adalah fosil Pithecanthropus erectus atau lelaki Jawa pada tahun 1891.
Di Indonesia, terdapat lebih daripada 17,000 pulau yang bertaburan di seluruh Indonesia, sehingga membolehkan spesifikasi dan evolusi yang berlainan di setiap rantau.
Salah satu spesies burung yang berkembang di Indonesia adalah burung syurga yang mempunyai bulu yang indah dan unik.
Evolusi juga berlaku di tumbuh -tumbuhan di Indonesia, seperti poket semar yang telah berkembang menjadi spesies yang lebih kecil dan tidak mempunyai beg lagi.
Terdapat juga spesies ikan yang berevolusi di Indonesia, seperti ikan arowana yang mempunyai keupayaan untuk melompat dari air dan makan mangsa di atas air.
Di Indonesia, terdapat spesies kadal langka yang dipanggil kadal buta yang tidak mempunyai mata kerana mereka tinggal di gua -gua gelap.
Evolusi juga berlaku dalam serangga di Indonesia, seperti rama -rama yang berkembang menjadi spesies yang lebih besar dan lebih indah.
Di Indonesia, terdapat spesies penyu yang berkembang menjadi spesies yang lebih kecil kerana mereka tinggal di kawasan yang terhad dan mengalami tekanan alam sekitar yang tinggi.
