Indonézia má viac ako 17 000 ostrovov a 54 716 km pobrežia, ktoré sa tiahnu, čo z nej robí jednu z krajín s najväčšími morskými zdrojmi na svete.
Ostrov Komodo v Indonézii je domovom najväčších jašteriových druhov na svete, Komodo.
Makassarský prieliv v Indonézii je jedným z miest stretnutia dvoch oceánskych prúdov, konkrétne južnej zemepisnej šírky a severnej zemepisnej šírky.
Indonézia má 3 oceány, ktoré obmedzujú svoje územie, konkrétne Tichý oceán na východ, Indický oceán na juh a ľadový oceán na sever.
Národný park Bunaken v North Sulawesi je jedným z najlepších miest potápania na svete s mimoriadnou morskou biodiverzitou.
Indonézia má druhý najväčší koralový útes na svete po Veľkom bariérovom útesu v Austrálii, s viac ako 3 500 druhmi rýb a 600 druhmi koralov.
Indonézske vody sú domovom niekoľkých vzácnych a ohrozených morských druhov, ako sú žraloky veľryby, obrovské rejnoky a zelené korytnačky.
Indonézske vody sú tiež bohaté na morské zdroje, ako sú tuniaky, krevety a kraby, ktoré sú zdrojom živobytia pre milióny rybárov.
Indonézia má niekoľko aktívnych sopiek, ako je Mount Merapi v centrálnej Java a Mount Agung na Bali, ktoré môžu ovplyvniť kvalitu okolitej morskej vody.
Indonézia má dlhú históriu v oblasti riadenia morských zdrojov s tradíciou trvalo udržateľného rybolovu a bohatej kultúry morských plodov.