Aceh Tsunami leta 2004 je bila najhujša naravna katastrofa v Indoneziji, ki je ubila več kot 200.000 ljudi.
Gozdni in zemljiški požari v Indoneziji so eden glavnih vzrokov onesnaževanja zraka v jugovzhodni Aziji.
Leta 2019 je Indonezija v zadnjih štirih letih doživela najslabše gozdne in kopenske požare z več kot 900.000 hektarjev goreče zemlje.
Naravne nesreče se v Indoneziji pogosto pojavljajo zaradi svoje lokacije v pacifiškem obroču, mesta za sestanke zemeljskih plošč, ki pogosto povzročajo potrese, cunami in vulkanski izbruh.
V letu 2018 sta potres in cunami v Palu v osrednjem Sulawesiju ubila več kot 4.300 ljudi.
Indonezija ima več kot 17.000 otokov, s čimer se sooča z velikimi izzivi v smislu upravljanja okolja in naravnih nesreč.
Naravne nesreče v Indoneziji pogosto povzročajo hude škode na okolju, kot sta erozija tal in onesnaževanje vode.
Indonezija je ena izmed držav z najvišjo stopnjo krčenja gozdov na svetu, kar ima za posledico izgubo habitatov prostoživečih živali in grozečo biotsko raznovrstnost.
Leta 2017 je Gunung Agung na Baliju izbruhnil in povzročil evakuacijo več kot 100.000 prebivalcev in znatno okoljsko škodo.
Čeprav je Indonezija doživela številne naravne nesreče in okoljske izzive, ima Indonezija tudi veliko čudovitih naravnih območij in izjemne biotske raznovrstnosti, kot sta nacionalni park Komodo in nacionalni park Lorentz.
