Інданезія налічвае больш за 17 500 астравоў, а 80% фауны, якая жыве ў Інданезіі, эндэмічная альбо сустракаецца толькі ў Інданезіі.
Арангутаны з'яўляюцца інданезійскімі эндэмічнымі жывёламі і сустракаюцца толькі ў Суматры і Калімантане.
Сланы суматрана і калімантан -сланы - гэта слановыя падвіды, якія сустракаюцца толькі ў Інданезіі.
Самая вялікая прэснаводная чарапаха ў свеце, гіганцкая чарапаха (Rafetus swinhoei) была знойдзена ў возеры Тоба, Паўночная Суматра.
У Інданезіі знойдзена больш за 600 відаў птушак, у тым ліку птушкі рая, якія маюць доўгія і прыгожыя дзюбы.
Суматранскія тыгры і яванскія тыгры - гэта падвіды тыгра, якія сустракаюцца толькі ў Інданезіі.
Найбуйнейшы ў свеце кракадзіл салёнай вады, кракадзіл лімана (Crocodylus porosus) сустракаецца ў інданезійскіх водах.
У Інданезіі жывуць некаторыя з найбуйнейшых відаў змяі ў свеце, напрыклад, гіганцкія пітоны (Python reticulatus) і зялёныя анаконда -змеі.
У Інданезіі сустракаецца больш за 200 відаў дэкаратыўнай рыбы, у тым ліку рыбу Бэта, якія папулярныя як дэкаратыўныя рыбы.
Інданезія мае вельмі разнастайныя віды насякомых, напрыклад, матылёк караля (Ornithoptera Alexandrae), які з'яўляецца адным з найбуйнейшых матылькоў у свеце.
