Indonēzijā visā salās ir vairāk nekā 17 000 salu, padarot kuģus par visefektīvākajiem un svarīgākajiem transporta līdzekļiem šajā valstī.
Tradicionālie Indonēzijas kuģi ir slaveni ar savu skaistumu un unikālo dizainu, piemēram, Phinisi, Jong un Pinisi.
Phinisi kuģis ir tradicionāls dienvidu Sulavesi kuģis, kas izgatavots no koka, un to izmanto dažādiem mērķiem, piemēram, transportēšanai, zivsaimniecībai un tūrismam.
Jong kuģis ir tradicionāls Javanese kuģis, ko izmanto tirdzniecībai, preču pārvadāšanai un pasažieru pārvadājumiem.
Pinisi kuģis ir tradicionāls dienvidaustrumu Sulavesi kuģis, kas ir slavens ar spēju tālu kuģot un izdzīvot sliktos laika apstākļos.
Indonēzijā ir arī moderns kravas kuģis, ko izmanto starptautiskai tirdzniecībai, piemēram, konteineru kuģi un tankkuģi.
Indonēzijā ir arī kruīza kuģis, kas piedāvā ārkārtas svētku pieredzi, piemēram, Star Clipper kruīza kuģus un Raja Ampat Explorer kruīza kuģi.
Indonēzijas tradicionālie kuģi bieži tiek izmantoti kultūras pasākumos, piemēram, Phinisi un Regatta Banda festivālā.
Indonēzijā ir liels skaits kuģu uzņēmumu, piemēram, Pelni, Jne un Jasa Raharja, kas nodrošina kravu un pasažieru pārvadāšanas pakalpojumus visā Indonēzijā.
Kuģi ir nozīmīga Indonēzijas iedzīvotāju dzīves sastāvdaļa, un tie bieži kļūst par spēka un drosmes simbolu Indonēzijas paražās un kultūrā.