Kruīza kuģu nozare Indonēzijā attīstījās tikai 1990. gados.
Pirmais kruīza kuģis Indonēzijā ir MV Prinsiph no Holland America Line, kurš ieradās Bali 1984. gadā.
Bali sala ir viens no galvenajiem kruīza kuģu mērķiem Indonēzijā tā apbrīnojamā dabas skaistuma dēļ.
2019. gadā Indonēzija saņēma apmēram 200 kruīza kuģus no dažādām valstīm.
Kruīza kuģi Indonēzijā piedāvā dažādas aktivitātes, piemēram, snorkelēšanu, niršanu, pastaigas mazās pilsētās un iepirkšanās tradicionālajos tirgos.
Kruīza kuģi Indonēzijā piedāvā arī garšīgus vietējos ēdienus, piemēram, ceptus rīsus, ceptas nūdeles un Satay.
Indonēzijā darbojas vairākas kruīza kuģu kompānijas, piemēram, Karaliskā Karību jūras reģiona, princeses kruīzi un karnevāla kruīza līnija.
Bez Bali citu kruīza kuģu galamērķis Indonēzijā ir Lombok, Komodo, Raja Ampat un Weh sala.
Kruīza kuģi Indonēzijā arī veicina Indonēzijas kultūras daudzveidību, uz kuģiem parādot tradicionālās dejas un muzikālās izrādes.
Kruīza kuģiem Indonēzijā ir arī korporatīvās sociālās atbildības (CSR) programma, lai palīdzētu vietējai sabiedrībai, sniedzot palīdzību un uzlabojot infrastruktūru.