كانت معركة سورابايا في 10 نوفمبر 1945 أكبر معركة وأكثرها دموية في إندونيسيا خلال ثورة الاستقلال.
كانت معركة بادري في غرب سومطرة في القرن التاسع عشر حربًا بين التقليديين والحداثيين في الإسلام.
يُعتقد أن معركة بوبا في عام 1357 بين مملكة سوندا وماجاباهيت في غرب جافا هي حدث مأساوي جعل الملك سيليوانجي مضطرًا لقتل ابنته.
معركة بالوبو في عام 1905 بين الهولنديين ومملكة العظام في جنوب سولاويزي كانت صراعًا استمر لمدة 20 عامًا.
معارك Lepa-Lepa في عام 1667 بين هولندا وجوا في جنوب سولاويزي معارك البحر بقيادة الأدميرال كورنيليس سبيلمان.
معركة سيمبانغ كانان في عام 1949 بين إندونيسيا وهولندا في ويست سومطرة كانت آخر معركة شملت الهولندية في النضال من أجل الاستقلال الإندونيسي.
تسببت معارك الرمال الطويلة في عام 1942 بين اليابان والحلفاء في سنغافورة في هزيمة كبيرة للحلفاء وتسببت في الاحتلال الياباني في سنغافورة لمدة ثلاث سنوات.
كانت معركة كارانج بولونج في عام 1945 بين القوات اليابانية والإندونيسية في غرب جاوة واحدة من المعارك المهمة خلال ثورة الاستقلال الإندونيسية.
معركة Tumenggung Wiradireja في عام 1825 بين هولندا وماتارام في وسط جافا ، قادت Tumenggung Wiradireja وهي شخصية من الأبطال الوطنيين الإندونيسيين.
كانت معركة باتافيا في عام 1619 معركة بين هولندا والبرتغالية التي سمحت للهولنديين بإنشاء باتافيا والسيطرة على تجارة التوابل في إندونيسيا.