Brwydr Surabaya ar Dachwedd 10, 1945 oedd y frwydr fwyaf a mwyaf gwaedlyd yn Indonesia yn ystod y Chwyldro Annibyniaeth.
Roedd brwydr Padri yng Ngorllewin Sumatra yn y 19eg ganrif yn rhyfel rhwng traddodiadolwyr a modernwyr yn Islam.
Credir bod brwydr Bubat yn 1357 rhwng teyrnas Sunda a Majapahit yng Ngorllewin Java yn ddigwyddiad trasig a wnaeth y Brenin Siliwangi i ladd ei ferch ei hun.
Roedd brwydr Palopo ym 1905 rhwng yr Iseldiroedd a theyrnas asgwrn yn Ne Sulawesi yn wrthdaro a barhaodd am 20 mlynedd.
Mae brwydrau Lepa-lepa yn 1667 rhwng yr Iseldiroedd a Gowa yn Ne Sulawesi yn frwydrau môr dan arweiniad y Llyngesydd Cornelis Speelman.
Brwydr Simpang Kanan ym 1949 rhwng Indonesia a'r Iseldiroedd yng Ngorllewin Sumatra oedd y frwydr olaf a oedd yn cynnwys yr Iseldiroedd yn y frwydr dros annibyniaeth Indonesia.
Achosodd brwydrau tywod hir ym 1942 rhwng Japan a chynghreiriaid yn Singapore golled fawr i'r cynghreiriaid ac achosi galwedigaeth Japan yn Singapore am dair blynedd.
Roedd Brwydr Karang Bolong ym 1945 rhwng milwyr Japaneaidd ac Indonesia yng Ngorllewin Java yn un o'r brwydrau pwysig yn ystod Chwyldro Annibyniaeth Indonesia.
Arweiniwyd brwydr Tumenggung Wiradireja ym 1825 rhwng yr Iseldiroedd a Mataram yng nghanol Java gan Tumenggung Wiradireja sy'n ffigwr o arwyr cenedlaethol Indonesia.
Roedd Batavia Battle yn 1619 yn frwydr rhwng yr Iseldiroedd a Phortiwgaleg a oedd yn caniatáu i'r Iseldiroedd sefydlu Batavia a rheoli'r fasnach sbeis yn Indonesia.
