10 नवंबर, 1945 को सुरबाया लड़ाई इंडोनेशिया में स्वतंत्रता क्रांति के दौरान सबसे बड़ी और सबसे खूनी लड़ाई थी।
19 वीं शताब्दी में पश्चिम सुमात्रा में पदरी लड़ाई इस्लाम में परंपरावादी और आधुनिकतावादियों के बीच एक युद्ध थी।
पश्चिम जावा में सुंडा साम्राज्य और माजापाहत के बीच 1357 में बुबत लड़ाई को एक दुखद घटना माना जाता है जिसने राजा सिलिवांगी को अपनी बेटी को मारने के लिए मजबूर कर दिया।
दक्षिण सुलावेसी में डच और द बोन ऑफ बोन के बीच 1905 में पालोपो की लड़ाई एक संघर्ष था जो 20 वर्षों तक चला।
दक्षिण सुलावेसी में नीदरलैंड और गोवा के बीच 1667 में लेपा-लेपा लड़ाई एडमिरल कॉर्नेलिस स्पीलमैन के नेतृत्व में समुद्री लड़ाई हैं।
पश्चिम सुमात्रा में इंडोनेशिया और नीदरलैंड के बीच 1949 में सिम्पांग कानन की लड़ाई आखिरी लड़ाई थी जिसमें इंडोनेशियाई स्वतंत्रता के संघर्ष में डच शामिल थे।
जापान और सिंगापुर में सहयोगियों के बीच 1942 में लॉन्ग रेत की लड़ाई ने मित्र राष्ट्रों के लिए एक बड़ी हार का कारण बना और तीन साल तक सिंगापुर में जापानी कब्जे का कारण बना।
पश्चिम जावा में जापानी और इंडोनेशियाई सैनिकों के बीच 1945 में करंग बोलोंग की लड़ाई इंडोनेशियाई स्वतंत्रता क्रांति के दौरान महत्वपूर्ण लड़ाई में से एक थी।
मध्य जावा में नीदरलैंड और मटरम के बीच 1825 में ट्यूमरगंग विरडिरजा की लड़ाई का नेतृत्व टुमगंगुंग विरादिर्जा ने किया था, जो इंडोनेशियाई राष्ट्रीय नायकों का एक आंकड़ा है।
1619 में बटाविया लड़ाई नीदरलैंड और पुर्तगाली के बीच एक लड़ाई थी जिसने डच को बटाविया स्थापित करने और इंडोनेशिया में मसाला व्यापार को नियंत्रित करने की अनुमति दी।