İndoneziyanın 5000 endemik növ də daxil olmaqla 30 mindən çox bitki növü var və ya yalnız İndoneziyada tapıla bilər.
İndoneziyanın ən məşhur bitkilərindən biri də dünyada ən böyük çiçəyi olan Rafflesia Arnoldii çiçəyidir, diametri 1 metrdir.
Hindistancevizi bitkiləri İndoneziyada ən vacib bitkilərdən biridir, çünki hindistan cevizi ağaclarının demək olar ki, bütün hissələri müxtəlif məqsədlər üçün istifadə edilə bilər.
İndoneziya, eyni zamanda, ölkədəki 4000-dən çox orkide növü olan orkide növünün müxtəlifliyi ilə də tanınır.
Düyü bitkiləri İndoneziyada əsas qida bitkiləridir və İndoneziya dünyanın ən böyük düyü istehsalçılarından biridir.
İndoneziyada müxtəlif xəstəliklərin müalicəsində istifadə olunan 3000-dən çox ənənəvi dərman bitkisi var.
Mercuii şam bitkiləri İndoneziyada tapılan ən çox yayılmış ağaclardan biridir və tez-tez ağac istehsalı üçün istifadə olunur.
İndoneziyada həmçinin unikal emalı ilə məşhur olan Luwak qəhvəsi kimi məşhur qəhvə bitkiləri var.
Kalimantanda, 20 metrə qədər böyüyə biləcək dırnaqlar var, onu dünyanın ən böyük bitkilərindən biri halına gətirir.
Melati çiçək bitkiləri İndoneziya milli bitkiləridir və tez-tez ənənəvi və dini mərasimlərdə istifadə olunur.