Indonesia mempunyai lebih daripada 30,000 spesies tumbuhan, termasuk 5,000 spesies endemik atau hanya boleh didapati di Indonesia.
Salah satu tumbuhan yang paling terkenal di Indonesia adalah bunga rafflesia arnoldii, yang mempunyai bunga terbesar di dunia dengan diameter 1 meter.
Tumbuhan kelapa adalah salah satu tumbuhan yang paling penting di Indonesia, kerana hampir semua bahagian pokok kelapa boleh digunakan untuk pelbagai tujuan.
Indonesia juga terkenal dengan kepelbagaian spesies anggreknya, dengan lebih daripada 4,000 spesies anggrek yang terdapat di seluruh negara.
Tumbuhan beras adalah tumbuhan makanan utama di Indonesia, dan Indonesia adalah salah satu pengeluar beras terbesar di dunia.
Di Indonesia terdapat lebih daripada 3,000 spesies tumbuhan perubatan tradisional yang digunakan untuk merawat pelbagai penyakit.
Tumbuhan pain Mercusii adalah salah satu pokok yang paling biasa yang terdapat di Indonesia, dan sering digunakan untuk pembuatan kayu.
Indonesia juga mempunyai tumbuhan kopi yang terkenal, seperti Luwak Coffee yang terkenal dengan pemprosesannya yang unik.
Di Kalimantan, terdapat kuku yang boleh tumbuh sehingga 20 meter, menjadikannya salah satu tumbuhan terbesar di dunia.
Tumbuhan bunga melati adalah tumbuhan kebangsaan Indonesia, dan sering digunakan dalam upacara tradisional dan agama.
