Інданезія мае больш за 17 000 астравоў і пражывае 10% усіх відаў млекакормячых, птушак і рэптылій у свеце.
Інданезійскі трапічны лес - адзін з найбуйнейшых у свеце і вельмі важны для захавання дзікай прыроды, у тым ліку арангутанаў, тыграў і сланоў.
Акрамя дзікай прыроды, у Інданезіі таксама ёсць розныя рэдкія і знікаючыя віды раслін, такія як рафлезія і чорныя архідэі.
Інданезія -гэта краіна з найбольшай колькасцю прыматаў у свеце, у тым ліку арангутанаў, сіяманга і доўгіх малпаў.
Нацыянальны парк Komodo, які знаходзіцца ва Усходняй Нуса -Тэнгагары, з'яўляецца домам для найбуйнейшых відаў яшчарак у свеце, Komodo.
Аноа, альбо дзікая карова Сулавесі, від, які знаходзіцца пад пагрозай знікнення і сустракаецца толькі ў Інданезіі.
Птушкі Парадайза, вядомыя сваімі прыгожымі пёрамі, сустракаюцца толькі на Папуа і навакольных астравах.
У Інданезіі жывуць некалькі буйных відаў котак, у тым ліку тыгры, леапарды і жука тыгра.
Чарапахавыя чарапахі - марскія віды, якія знаходзяцца пад пагрозай знікнення, і ў Інданезіі ёсць некалькі важных месцаў для захавання, у тым ліку нацыянальны парк Вакатобі і нацыянальны парк Комада.
Захаванне дзікай прыроды вельмі важна для падтрымання балансу інданезійскіх экасістэм і абароны унікальных і рэдкіх відаў у свеце.