Indonésie má více než 17 000 ostrovů a je domovem 10% všech druhů savců, ptáků a plazů na světě.
Indonéský deštný prales je jedním z největších na světě a je velmi důležitý pro ochranu přírody, včetně orangutanů, tygrů a slonů.
Kromě volně žijících živočichů má Indonésie také řadu vzácných a ohrožených rostlinných druhů, jako je toabelesie a černé orchideje.
Indonésie je země s největším počtem primátů na světě, včetně orangutanů, siamangu a dlouhých opic.
Národní park Komodo, který se nachází ve východní Nusa Tenggara, je domovem největšího druhu ještěrky na světě, Komodo.
ANOA, nebo Sulawesi Wild Cow, druh, který je ohrožen a vyskytuje se pouze v Indonésii.
Ptáci ráje, známí svými krásnými peří, se nacházejí pouze na Papua a okolních ostrovech.
Indonésie je domovem několika velkých druhů koček, včetně tygrů, leopardů a brouka.
Želví želvy jsou ohroženými mořskými druhy a Indonésie má několik důležitých míst pro jejich ochranu, včetně národního parku Wakatobi a národního parku Komodo.
Ochrana volně žijících živočichů je velmi důležitá pro udržení rovnováhy indonéských ekosystémů a ochrany jedinečných a vzácných druhů na světě.