Indonezija ima več kot 17.000 otokov in živi 10% vseh vrst sesalcev, ptic in plazilcev na svetu.
Indonezijski deževni gozd je eden največjih na svetu in je zelo pomemben za ohranjanje prostoživečih živali, vključno z orangutani, tigri in sloni.
Indonezija ima poleg prostoživečih živali tudi različne redke in ogrožene rastlinske vrste, kot so rafflezija in črne orhideje.
Indonezija je država z največjim številom primatov na svetu, vključno z opicami z orangutani, siamang in dolgimi ploščami.
Nacionalni park Komodo, ki se nahaja v vzhodni Nusa Tenggara, je dom največjih vrst kuščarjev na svetu, Komodo.
Anoa ali Sulawesi divja krava, vrsta, ki je ogrožena in jo najdemo samo v Indoneziji.
Rajske ptice, znane po čudovitem perju, najdemo le v Papui in okoliških otokih.
Indonezija je dom več velikih mačjih vrst, vključno s tigri, leopardi in beetle tigra.
Želve želve so ogrožene morske vrste, Indonezija pa ima več pomembnih krajev za njihovo ohranjanje, vključno z nacionalnim parkom Wakatobi in nacionalnim parkom Komodo.
Ohranjanje prostoživečih živali je zelo pomembno za ohranjanje ravnovesja indonezijskih ekosistemov in zaščito edinstvenih in redkih vrst na svetu.