L'histoire de la science en Indonésie a commencé à l'époque du royaume de Srivijaya au 7ème siècle.
Au 9ème siècle, Falak (astronomie) s'est développé en Indonésie avec l'Observatoire à Jambi.
Pendant le Royaume de Mataram, la science médicale s'est également développée avec la pratique de la médecine javanaise traditionnelle.
Au 17ème siècle, la science occidentale a commencé à être introduite en Indonésie par les missionnaires et commerçants néerlandais.
Au XVIIIe siècle, les sciences et la technologie occidentales se développent en Indonésie avec la présence de sociétés néerlandaises qui ouvrent des usines et des plantations.
Au 19e siècle, les sciences et la technologie occidentales se sont développées avec une éducation formelle introduite par le gouvernement néerlandais des Indes orientales.
Pendant l'indépendance indonésienne, la science et la technologie sont devenues le principal objectif du développement national.
En 1976, l'Indonésie a réussi à lancer son premier satellite, Palapa A1, qui a fait de l'Indonésie un pays tiers en Asie qui a son propre satellite.
En 2007, l'Indonésie a réussi à former de l'huile au large des côtes au large de la côte de Cepu, dans le centre de Java.
À l'heure actuelle, l'Indonésie se concentre sur le développement de la science et de la technologie pour améliorer la compétitivité et le bien-être de la communauté.