द्वितीय विश्व युद्ध के दौरान, इंडोनेशिया को डच द्वारा उपनिवेशित किया गया था जो तब 1942 में जापान द्वारा कब्जा कर लिया गया था।
जापान दक्षिण पूर्व एशिया को नियंत्रित करने के लिए एक आधार के रूप में इंडोनेशिया का उपयोग करता है।
इंडोनेशिया ब्रिटेन, अमेरिका और ऑस्ट्रेलिया जैसे जापानी सैनिकों और संबद्ध बलों के बीच एक भयंकर लड़ाई का स्थान है।
जापानी कब्जे के दौरान, इंडोनेशियाई लोगों ने विभिन्न प्रकार के उत्पीड़न और शोषण का अनुभव किया, जैसे कि जबरन श्रम और हिरासत।
इतना ही नहीं, जापान ने इंडोनेशिया के शहरों पर बमबारी और हवाई हमले भी किए, जैसे कि सुरबाया और जकार्ता।
इंडोनेशिया सुकर्णो और हट्टा के नेतृत्व में जापानी सैनिकों और इंडोनेशियाई केंद्र सरकार के बलों के बीच युद्ध का स्थान भी है।
जापान के आत्मसमर्पण करने के बाद, इंडोनेशिया ने 17 अगस्त, 1945 को अपनी स्वतंत्रता की घोषणा की, लेकिन डच ने स्वतंत्रता को पहचान नहीं लिया और 1947 में डच सैन्य आक्रामकता I शुरू की।
इंडोनेशियाई युद्ध का स्वतंत्रता चार साल तक चला और 1949 में डच द्वारा इंडोनेशियाई स्वतंत्रता की मान्यता के साथ समाप्त हुआ।
द्वितीय विश्व युद्ध के दौरान, इंडोनेशिया आक्रमणकारियों के खिलाफ प्रतिरोध और भूमिगत आंदोलनों का स्थान भी था, जैसे कि इंडोनेशियाई युवा आंदोलन, पीपुल्स सिक्योरिटी आर्मी और हिजबुल्लाह।
द्वितीय विश्व युद्ध ने इंडोनेशिया में बड़े बदलाव लाए, जिसमें एक मजबूत राष्ट्रवाद आंदोलन का उद्भव शामिल था और अंततः उपनिवेशवाद से स्वतंत्रता हासिल की।