Zdraví indonéského lidu je odpovědností vlády po nezávislosti v roce 1945.
Program hromadné imunizace v Indonésii začal v roce 1950, aby překonal vypuknutí nemocí, které se šíří.
V 70. letech 20. století se Indonésii podařilo bojovat proti ohniskám neštovic, která byla hlavními problémy v komunitě.
V 90. letech se Indonésii podařilo snížit úmrtnost matek a dětí z velmi vysokého předtím.
V roce 2000 se Indonésii podařilo snížit počet případů malárie a TB s programem léčby a prevence.
Národní program zdravotního pojištění (JKN), který byl zahájen v roce 2014, byl jedním z vládních snah o zlepšení přístupu zdraví pro všechny úrovně společnosti.
Indonésie je jednou ze zemí s největším počtem zdravotnických pracovníků na světě.
Indonésie má také mnoho univerzit a vzdělávacích institucí, které nabízejí studijní programy veřejného zdraví.
Některé nemoci, které jsou v Indonésii stále problémem, zahrnují HIV/AIDS, cukrovku a srdeční choroby.
Používání tradiční medicíny je stále široce prováděno lidmi z Indonésie jako alternativní léčba.