Indonesiske folks helbred er regeringens ansvar efter uafhængighed i 1945.
Massimmuniseringsprogrammet i Indonesien begyndte i 1950 for at overvinde udbruddet af sygdomme, der spredte sig.
I 1970'erne lykkedes det Indonesien at kæmpe for kopperudbrud, som var de største problemer i samfundet.
I 1990'erne lykkedes det Indonesien at reducere mødre- og børnedødelighed fra en meget høj før.
I 2000'erne lykkedes det Indonesien at reducere antallet af tilfælde af malaria og TB med et behandlings- og forebyggelsesprogram.
Det nationale sundhedsforsikringsprogram (JKN), der blev lanceret i 2014, var en af regeringens bestræbelser på at forbedre sundhedsadgangen for alle niveauer i samfundet.
Indonesien er et af de lande med det største antal sundhedsarbejdere i verden.
Indonesien har også mange universiteter og uddannelsesinstitutioner, der tilbyder programmer for undersøgelser af folkesundhed.
Nogle sygdomme, der stadig er et problem i Indonesien, inkluderer HIV/AIDS, diabetes og hjertesygdom.
Brugen af traditionel medicin udføres stadig bredt af befolkningen i Indonesien som en alternativ behandling.