Zdravie indonézskeho ľudu je zodpovednosťou vlády po nezávislosti v roku 1945.
Program hromadnej imunizácie v Indonézii sa začal v roku 1950 na prekonanie prepuknutia chorôb, ktoré sa šírili.
V 70. rokoch 20. storočia sa Indonézii podarilo bojovať proti ohniskám kiahní, ktoré boli hlavnými problémami v komunite.
V 90. rokoch 20. storočia sa Indonézii podarilo znížiť úmrtnosť matiek a detských detí z veľmi vysokej.
V roku 2000 sa Indonézii podarilo znížiť počet prípadov malárie a TBC pomocou programu liečby a prevencie.
Národný program zdravotného poistenia (JKN), ktorý bol spustený v roku 2014, bol jedným z úsilia vlády o zlepšenie prístupu k zdraviu pre všetky úrovne spoločnosti.
Indonézia je jednou z krajín s najväčším počtom zdravotníckych pracovníkov na svete.
Indonézia má tiež mnoho univerzít a vzdelávacích inštitúcií, ktoré ponúkajú študijné programy v oblasti verejného zdravia.
Niektoré choroby, ktoré sú v Indonézii stále problémom, zahŕňajú HIV/AIDS, cukrovku a srdcové choroby.
Používanie tradičnej medicíny stále všeobecne vykonávajú Indonézia ako alternatívna liečba.
