Zdravje Indonezijcev je odgovornost vlade po osamosvojitvi leta 1945.
Program množične imunizacije v Indoneziji se je začel leta 1950, da bi premagal izbruh bolezni, ki so se širile.
V 70. letih prejšnjega stoletja se je Indoneziji uspelo boriti proti izbruhom malih strupov, ki so bili glavni problemi v skupnosti.
V devetdesetih letih prejšnjega stoletja je Indoneziji uspelo z zelo visokim znižanjem stopnje umrljivosti mater in otrok.
V 2000 -ih je Indoneziji uspelo zmanjšati število primerov malarije in TB s programom zdravljenja in preprečevanja.
Nacionalni program zdravstvenega zavarovanja (JKN), ki je bil ustanovljen leta 2014, je bil eno od vladnih prizadevanj za izboljšanje dostopa do zdravja za vse ravni družbe.
Indonezija je ena od držav z največjim številom zdravstvenih delavcev na svetu.
Indonezija ima tudi številne univerze in izobraževalne ustanove, ki ponujajo programe javnega zdravja.
Nekatere bolezni, ki so v Indoneziji še vedno problem, vključujejo HIV/AIDS, diabetes in srčne bolezni.
Uporaba tradicionalne medicine še vedno široko izvajajo prebivalci Indonezije kot alternativno zdravljenje.
