أول جاسوس إندونيسي مشهور هو Raden Suryodiningrat ، والمعروف باسم Ki Ageng Selo. كان جاسوس مملكة ماتارام في القرن السادس عشر.
أحد الجواسيس الشهير في إندونيسيا هو تان مالاكا ، وهو ثوري وفكري يلعب دورًا مهمًا في النضال من أجل الاستقلال الإندونيسي.
في حرب الاستقلال الإندونيسية ، أصبح اللفتنانت العقيد أليكس كويلارانج جاسوسًا ناجحًا للغاية للجيش الوطني الإندونيسي.
أحد الجواسيس الشهيرون في إندونيسيا هو Soekarno ، الذي عمل في البداية كوكيل استخبارات هولندي قبل أن يصبح أول رئيس لإندونيسيا.
أحد أكثر الجواسيس الشهير في إندونيسيا هو مونير إن ثاليب ، الذي قُتل في عام 2004 بعد أن كشف عن انتهاكات لحقوق الإنسان من قبل الجيش الإندونيسي.
خلال الحرب العالمية الثانية ، تم إرسال زعيم الحركة الوطنية الإندونيسية ، Sukarno ، إلى Banten من قبل الجيش الياباني لجمع المعلومات الاستخباراتية حول الوضع في إندونيسيا.
واحدة من الجواسيس الشهير في إندونيسيا هي إليزابيث بيساني ، التي تعمل كصحفية وباحث وبائي قبل أن تصبح جاسوسًا للحكومة الإندونيسية.
خلال عهد Soeharto ، عمل بامبانغ هيندرسو دانوري ، الذي أصبح فيما بعد رئيس الشرطة الإندونيسية ، كجاسوس للحكومة.
في عام 1965 ، تعرض مؤتمر العمل الدولي في جاكرتا التسلل من قبل عملاء الاستخبارات الإندونيسية المتنكرين كمندوبين.
في عام 2005 ، تم إدانة عميل الاستخبارات الإندونيسي السابق ، راسييد راجاسا ، بقتل ناشط في مجال حقوق الإنسان وحُكم عليه بالسجن مدى الحياة.