Първият известен индонезийски шпионин е Raden Suryodiningrat, известен като Ki Ageng Selo. Той беше шпионинът на царството на Матарам през 16 век.
Едно от известните шпиони в Индонезия е Тан Малака, революционен и интелектуалец, който играе важна роля в борбата за индонезийската независимост.
В индонезийската война за независимост лейтенант полковник Алекс Кавиларанг стана много успешен шпионин за индонезийската национална армия.
Едно от другите известни шпиони на Индонезия е Сокарно, който първоначално е работил като холандски разузнавателен агент, преди да стане първият президент на Индонезия.
Едно от най -противоречивите известни шпиони в Индонезия е Мунир каза Талиб, който беше убит през 2004 г., след като разкри нарушения на правата на човека от индонезийските военни.
По време на Втората световна война лидерът на индонезийското национално движение Сукарно е изпратен в Бантен от японските военни, за да събере разузнаване за ситуацията в Индонезия.
Една от другите известни шпиони на Индонезия е Елизабет Писани, която работи като епидемиологичен журналист и изследовател, преди да стане шпионин за индонезийското правителство.
По време на царуването на Соехарто Бамбанг Хендарсо Данури, който по -късно става ръководител на индонезийската полиция, работи като шпионин за правителството.
През 1965 г. Международният конгрес на труда в Джакарта е проникнат от индонезийските разузнавачи, прикрити като делегати.
През 2005 г. бившият индонезийски разузнавателен агент Расиид Раджаса беше признат за виновен за убийството на активист на правата на човека и беше осъден на доживотен затвор.