पहला प्रसिद्ध इंडोनेशियाई जासूस रेडेन सूर्योडिनिंग्रैट है, जिसे की एगेंग सेलो के नाम से जाना जाता है। वह 16 वीं शताब्दी में माटरम राज्य का जासूस था।
इंडोनेशिया के प्रसिद्ध जासूसों में से एक टैन मलका है, जो एक क्रांतिकारी और बौद्धिक है जो इंडोनेशियाई स्वतंत्रता के लिए संघर्ष में एक महत्वपूर्ण भूमिका निभाता है।
इंडोनेशियाई युद्ध में स्वतंत्रता के युद्ध में, लेफ्टिनेंट कर्नल एलेक्स काविलरंग इंडोनेशियाई राष्ट्रीय सेना के लिए एक बहुत ही सफल जासूस बन गए।
इंडोनेशिया के अन्य प्रसिद्ध जासूसों में से एक सोखरनो है, जिसने शुरू में इंडोनेशिया के पहले राष्ट्रपति बनने से पहले डच खुफिया एजेंट के रूप में काम किया था।
इंडोनेशिया के सबसे विवादास्पद प्रसिद्ध जासूसों में से एक मुनीर ने कहा कि थालिब, जो 2004 में इंडोनेशियाई सेना द्वारा मानवाधिकारों के उल्लंघन का खुलासा करने के बाद मारा गया था।
द्वितीय विश्व युद्ध के दौरान, इंडोनेशियाई राष्ट्रीय आंदोलन के नेता सुकर्णो को जापानी सेना द्वारा इंडोनेशिया में स्थिति के बारे में खुफिया जानकारी इकट्ठा करने के लिए बेंटेन भेजा गया था।
इंडोनेशिया के अन्य प्रसिद्ध जासूसों में से एक एलिजाबेथ पिसानी है, जो इंडोनेशियाई सरकार के लिए जासूस बनने से पहले एक महामारी विज्ञान के पत्रकार और शोधकर्ता के रूप में काम करता है।
सोहार्टो शासनकाल के दौरान, बम्बांग हेंडर्सो दानुरी, जो बाद में इंडोनेशियाई पुलिस के प्रमुख बने, ने सरकार के लिए जासूस के रूप में काम किया।
1965 में, जकार्ता में अंतर्राष्ट्रीय श्रम कांग्रेस को इंडोनेशियाई खुफिया एजेंटों द्वारा प्रतिनिधियों के रूप में प्रच्छन्न किया गया था।
2005 में, इंडोनेशियाई खुफिया एजेंट, रसीद राजासा को एक मानवाधिकार कार्यकर्ता की हत्या का दोषी पाया गया और उन्हें आजीवन कारावास की सजा सुनाई गई।
