La prima famosa spia indonesiana è Raden Suryodiningrat, noto come Ki Ageng Selo. Era la spia del regno di Mataram nel XVI secolo.
Una delle famose spie indonesiane è Tan Malaka, un rivoluzionario e intellettuale che svolge un ruolo importante nella lotta per l'indipendenza indonesiana.
Nella guerra d'indipendenza indonesiana, il tenente colonnello Alex Kawilarang divenne una spia di grande successo per l'esercito nazionale indonesiano.
Una delle altre famose spie dell'Indonesia è Soekarno, che inizialmente ha lavorato come agente di intelligence olandese prima di diventare il primo presidente dell'Indonesia.
Una delle spie famose più controverse dell'Indonesia è Munir ha affermato che Thalib, che è stato ucciso nel 2004 dopo aver rivelato violazioni dei diritti umani da parte dei militari indonesiani.
Durante la seconda guerra mondiale, il leader del movimento nazionale indonesiano, Sukarno, fu inviato a Banten dai militari giapponesi per raccogliere intelligenza sulla situazione in Indonesia.
Una delle altre famose spie dell'Indonesia è Elizabeth Pisani, che lavora come giornalista e ricercatore epidemiologica prima di diventare una spia per il governo indonesiano.
Durante il regno di Soeharto, Bambang Henndarso Danuri, che in seguito divenne capo della polizia indonesiana, lavorò come spia per il governo.
Nel 1965, il Congresso internazionale del lavoro a Jakarta fu infiltrato dagli agenti dell'intelligence indonesiana travestiti da delegati.
Nel 2005, l'ex agente di intelligence indonesiano, Rasyid Rajasa, è stato dichiarato colpevole dell'omicidio di un attivista per i diritti umani ed è stato condannato all'ergastolo.