İlk məşhur İndoneziya casusu, Ki Ageng Selo kimi tanınan Raden Suryodiningratdır. 16-cı əsrdə Mataram Krallığının casusu idi.
İndoneziyanın məşhur casuslarından biri İndoneziya müstəqilliyi uğrunda mübarizədə mühüm rol oynayan İnqilabi və İntellektual Tan Malaka.
İndoneziya müstəqillik müharibəsində, leytenant polkovnik Alex Kawilarang İndoneziya Milli Ordusu üçün çox uğurlu bir casus oldu.
İndoneziyanın digər məşhur casuslarından biri, əvvəlcə İndoneziyanın ilk prezidenti olmamışdan əvvəl Hollandiya kəşfiyyatçısı kimi işləyən soekarnodur.
İndoneziyanın ən mübahisəli məşhur casuslarından biri Münir, İndoneziya Hərbi tərəfindən insan hüquqlarının pozulduqdan sonra 2004-cü ildə öldürülən Talibin dedi.
İndoneziyanın İndoneziya Milli Hərəkatının lideri II Dünya Müharibəsi dövründə, İndoneziyadakı vəziyyət haqqında kəşfiyyat toplamaq üçün Yapon hərbçiləri tərəfindən Bantenə göndərildi.
İndoneziyanın digər məşhur casuslarından biri İndoneziya hökumətinə casus olmamışdan əvvəl epidemioloji jurnalist və tədqiqatçı kimi işləyən Elizabeth Pisanidir.
Seeharto hakimiyyətində, sonradan İndoneziya polisinin başçısı olan Bambang Hendarso Danuri, hökumət üçün casusluq işləmişdir.
1965-ci ildə Cakartadakı Beynəlxalq Əmək Konqresi, nümayəndə olaraq gizlədilən İndoneziya kəşfiyyat agentləri tərəfindən sızdırıldı.
2005-ci ildə İndoneziyanın keçmiş kəşfiyyat agenti Rasyid Rajasa, hüquq müdafiəçisinin öldürülməsində günahkar bilinib və ömürlük həbs cəzasına məhkum edildi.
