İndoneziya memarlığının tarixi tarixdən əvvəlki dövrlərdə başlayır, insanlar ağac və bambukdan olan stilts üzərində ev tikməyə başlayırlar.
7-ci əsrdə Sumatra yerləşən Srivijaya Krallığı, Məbədlərin və Dəyirmi Stupanın xüsusiyyətləri ilə İndoneziya memarlıq inkişafının mərkəzi oldu.
14-cü əsrdə Cavada mərkəzləşmiş Məcapahit Krallığı Javanese memarlığının inkişaf mərkəzi oldu, şəhərin məbədlərinin və qalalarının xüsusiyyətləri ilə.
Hollandiya müstəmləkə dövründə İndoneziya memarlığı güclü bir Avropa üslubunun təsiri ilə böyük dəyişikliklərə məruz qaldı. Hollandiya müstəmləkə memarlıq tərzi İndoneziyada bir çox köhnə binalarda rast gəlmək olar.
İndoneziya müstəqilliyi dövründə İndoneziya memarlığı, Avropa və ABŞ-dan müasir memarlıq üslubunu oxuyan bir çox İndoneziyalı memarlarla sürətli inkişaf yaşadı.
İndoneziyanın müstəqillik dövründə məşhur memarlardan biri də İndoneziyanın ilk prezidenti olan Süvarno idi. Sukarno, müasir üslublarla ənənəvi elementləri birləşdirən İndoneziya Milli Memarlıq üslubunu hazırlayan bir memar kimi tanınır.
Ən məşhur İndoneziya memarlıq binasının bir nümunəsi dünyanın ən böyük Buddist məbədi olan Borobudur Məbədidir. Borobudur Məbədi 8-ci əsrdə inşa edilmiş və UNESCO-nun dünya irsidir.
Məşhur İndoneziyalı müasir memarlıq binasının bir nümunəsi İndoneziyanın milli abidəsi olan Monasdır. Monas 1961-ci ildə inşa edilmiş və hündürlüyü 132 metrdir.
Məşhur İndoneziyanın ənənəvi memarlıq binasının bir nümunəsi Cənubi Sulawesi'nin yaranan Toraja ənənəvi evidir. Toraja Ənənəvi Evi, unikal bir forma var və gözəl oymalarla bəzədilib.
Hazırda İndoneziya memarlığı bir çox yenilik inkişaf etdirməyə və təcrübə etməyə davam edir. Bir çox İndoneziya memarları ekoloji cəhətdən təmiz memarlıq üslublarını inkişaf etdirir və gözəl və funksional binalar tikmək üçün yerli materiallardan istifadə edir.