Historien om den indonesiske arkitektur begynder i forhistorisk tid, hvor mennesker begynder at bygge huse på stylter fra træ og bambus.
I det 7. århundrede blev kongeriget Srivijaya med base i Sumatra centrum for den indonesiske arkitektoniske udvikling med egenskaberne ved templer og rund stupa.
I det 14. århundrede blev Majapahit -kongeriget centreret i Java centrum for den javanske arkitekturudvikling med egenskaberne ved templerne og fæstningen i byen.
I den hollandske kolonitid gennemgik den indonesiske arkitektur store ændringer med indflydelse af en stærk europæisk stil. Hollandsk kolonial arkitektonisk stil findes i mange gamle bygninger i Indonesien.
Under indonesisk uafhængighed oplevede den indonesiske arkitektur hurtig udvikling med mange indonesiske arkitekter, der studerede stilen med moderne arkitektur fra Europa og De Forenede Stater.
En af Indonesiens berømte arkitekter i uafhængighedsperioden var Sukarno, der også var den første præsident for Indonesien. Sukarno er kendt som en arkitekt, der udviklede stilen med den indonesiske nationale arkitektur, der kombinerede traditionelle elementer med moderne stilarter.
Et eksempel på den mest berømte indonesiske arkitektoniske bygning er Borobudur -templet, som er det største buddhistiske tempel i verden. Borobudur Temple blev bygget i det 8. århundrede og er en UNESCOs verdensarv.
Et eksempel på den berømte indonesiske moderne arkitektoniske bygning er Monas, som er det indonesiske nationale monument. Monas blev bygget i 1961 og har en højde på 132 meter.
Et eksempel på den berømte indonesiske traditionelle arkitektoniske bygning er Toraja Traditional House, der stammer fra South Sulawesi. Toraja traditionelle hus har en unik form og er dekoreret med smukke udskæringer.
På nuværende tidspunkt udvikler og oplever indonesisk arkitektur sig med at udvikle og opleve mange innovationer. Mange indonesiske arkitekter udvikler miljøvenlige arkitektoniske stilarter og bruger lokale materialer til at bygge smukke og funktionelle bygninger.