História indonézskej architektúry sa začína v praveku, keď ľudia začínajú stavať domy na chodúľoch z dreva a bambusu.
V 7. storočí sa kráľovstvo Srivijaya so sídlom v Sumatre stalo centrom indonézskeho architektonického rozvoja s charakteristikami chrámov a okrúhlym Stupou.
V 14. storočí sa kráľovstvo Majapahit zameralo v Jave centrom rozvoja javánskej architektúry s charakteristikami chrámov a pevností mesta.
Počas holandského koloniálneho obdobia prešla indonézska architektúra závažné zmeny s vplyvom silného európskeho štýlu. Holandský koloniálny architektonický štýl sa nachádza v mnohých starých budovách v Indonézii.
Počas indonézskej nezávislosti zažila indonézska architektúra rýchly rozvoj s mnohými indonézskymi architektmi, ktorí študovali štýl modernej architektúry z Európy a Spojených štátov.
Jedným zo slávnych indonézskych architektov počas obdobia nezávislosti bol Sukarno, ktorý bol tiež prvým prezidentom Indonézie. Sukarno je známy ako architekt, ktorý vyvinul štýl indonézskej národnej architektúry, ktorá kombinovala tradičné prvky s modernými štýlmi.
Jedným z príkladov najslávnejšej indonézskej architektonickej budovy je chrám Borobudur, ktorý je najväčším budhistickým chrámom na svete. Chrám Borobudur bol postavený v 8. storočí a je svetovým dedičstvom UNESCO.
Jedným z príkladov slávnej indonézskej modernej architektonickej budovy sú Monas, ktorý je indonézskou národnou pamiatkou. Monas bol postavený v roku 1961 a má výšku 132 metrov.
Jedným z príkladov slávnej indonézskej tradičnej architektonickej budovy je tradičný dom toraja, ktorý pochádza z južného Sulawesi. Tradičný dom toraja má jedinečný tvar a je zdobený krásnymi rezbami.
V súčasnosti indonézska architektúra naďalej rozvíja a zažíva mnoho inovácií. Mnoho indonézskych architektov vyvíja architektonické štýly šetrné k životnému prostrediu a používajú miestne materiály na výstavbu krásnych a funkčných budov.