Historie indonéské architektury začíná v pravěku, kdy lidé začínají stavět domy na chůdách ze dřeva a bambusu.
V 7. století se Království Srivijaya se sídlem v Sumatra stalo centrem indonéského architektonického rozvoje s charakteristikami chrámů a kulatou stupa.
Ve 14. století se království Majapahit soustředěné v Javě stalo střediskem vývoje Javanese Architecture Development s charakteristikami chrámů a pevností města.
Během nizozemského koloniálního období prošla indonéská architektura významné změny s vlivem silného evropského stylu. Holandský koloniální architektonický styl najdete v mnoha starých budovách v Indonésii.
Během indonéské nezávislosti zažila indonéská architektura rychlý rozvoj s mnoha indonéskými architekty, kteří studovali styl moderní architektury z Evropy a Spojených států.
Jedním ze slavných indonéských architektů v období nezávislosti byl Sukarno, který byl také prvním indonéským prezidentem. Sukarno je známý jako architekt, který vyvinul styl indonéské národní architektury, která kombinovala tradiční prvky s moderními styly.
Jedním z příkladů nejslavnější indonéské architektonické budovy je chrám Borobudur, který je největším buddhistickým chrámem na světě. Chrám Borobudur byl postaven v 8. století a je světovým dědictvím UNESCO.
Jedním z příkladů slavné indonéské moderní architektonické budovy je Monas, což je indonéská národní památka. Monas byl postaven v roce 1961 a má výšku 132 metrů.
Jedním z příkladů slavné indonéské tradiční architektonické budovy je tradiční dům Toraja, který pochází z South Sulawesi. Tradiční dům Toraja má jedinečný tvar a je zdoben krásnými řezbami.
V současné době indonéská architektura nadále rozvíjí a zažívá mnoho inovací. Mnoho indonéských architektů vyvíjí ekologické architektonické styly a používá místní materiály k budování krásných a funkčních budov.