Toisen maailmansodan aikana Indonesia kolonisoi hollantilaiset, jotka Japani miehitti sitten vuonna 1942.
Japani käyttää Indonesiaa perustana Kaakkois -Aasian hallinnassa.
Indonesia on kovan taistelun sijainti japanilaisten joukkojen ja liittolaisten joukkojen, kuten Ison -Britannian, Amerikan ja Australian, välillä.
Japanin miehityksen aikana indonesialaiset ihmiset kokenut erilaisia sorron ja hyväksikäytön, kuten pakkotyötä ja pidätystä.
Paitsi, että Japani teki myös pommituksia ja ilmaiskuja Indonesian kaupungeissa, kuten Surabaya ja Jakarta.
Indonesia on myös sodan sijainti Japanin joukkojen ja Indonesian keskushallinnon joukkojen välillä, joita johtavat Sukarno ja Hatta.
Japanin antamisen jälkeen Indonesia julisti itsenäisyytensä 17. elokuuta 1945, mutta hollantilaiset eivät tunnustaneet itsenäisyyttä ja aloittivat Alankomaiden sotilaallisen aggression I 1947.
Indonesian itsenäisyyssota kesti neljä vuotta ja päättyi hollantilaisten Indonesian itsenäisyyden tunnustamiseen vuonna 1949.
Toisen maailmansodan aikana Indonesia oli myös vastustus- ja maanalaisten liikkeiden sijainti hyökkääjiä vastaan, kuten Indonesian nuorisoliike, ihmisten turvallisuusarmeija ja Hezbollah.
Toinen maailmansota toi suuria muutoksia Indonesiaan, mukaan lukien vahvan nationalismin liikkeen synty ja lopulta saavutti riippumattomuuden kolonialismista.