Semasa Perang Dunia II, Indonesia dijajah oleh Belanda yang kemudiannya diduduki oleh Jepun pada tahun 1942.
Jepun menggunakan Indonesia sebagai asas untuk mengawal Asia Tenggara.
Indonesia adalah lokasi pertempuran sengit antara tentera Jepun dan pasukan bersekutu seperti Britain, Amerika dan Australia.
Semasa pendudukan Jepun, rakyat Indonesia mengalami pelbagai jenis penindasan dan eksploitasi, seperti buruh dan penahanan paksa.
Bukan sahaja itu, Jepun juga melakukan pengeboman dan serangan udara di bandar -bandar di Indonesia, seperti Surabaya dan Jakarta.
Indonesia juga merupakan lokasi perang antara tentera Jepun dan pasukan kerajaan pusat Indonesia yang diketuai oleh Sukarno dan Hatta.
Selepas Jepun menyerah, Indonesia mengisytiharkan kemerdekaannya pada 17 Ogos 1945, tetapi Belanda tidak mengiktiraf kemerdekaan dan memulakan pencerobohan tentera Belanda pada tahun 1947.
Perang Kemerdekaan Indonesia berlangsung selama empat tahun dan berakhir dengan pengiktirafan kemerdekaan Indonesia oleh Belanda pada tahun 1949.
Semasa Perang Dunia II, Indonesia juga merupakan lokasi perlawanan dan pergerakan bawah tanah terhadap penceroboh, seperti pergerakan belia Indonesia, tentera keselamatan rakyat, dan Hizbullah.
Perang Dunia II membawa perubahan besar ke Indonesia, termasuk kemunculan pergerakan nasionalisme yang kuat dan akhirnya mencapai kemerdekaan dari penjajahan.