Prvním super počítačem v Indonésii je Y-MP Cray ve vlastnictví Lipi v roce 1992.
V současné době je nejrychlejším superpočítačem v Indonésii agarwood provozovaný BPPT s maximální rychlostí 1,5 petaflop.
Indonésie má několik dalších superpočítačů, jako je Terascale Computing System (TCS) a HPC-UGM.
Superpočítače se používají v mnoha oborech v Indonésii, včetně vědeckého výzkumu, modelování počasí a předpovědí přírodních katastrof.
Indonésie má národní program pro vývoj superpočítačů a souvisejících technologií, známých jako Národní program pro výzkum a inovace technologií Supercomputer (Prism).
Superpočítač vyrobený v Indonésii s názvem Merah Putih byl spuštěn v roce 2018 a očekává se, že zvýší konkurenceschopnost indonéské technologie.
Superpočítače se také používají k vývoji aplikací pro umělou inteligenci a automatizaci v Indonésii.
BPPT je vládní instituce odpovědná za provoz několika superpočítačů v Indonésii.
Řada univerzit v Indonésii má také své vlastní superpočítače, včetně Gadjah Mada University a Bandung Institute of Technology.
Indonésie uspořádala v roce 2018 konferenci Asie-Pacific Conference o Super Computers, která obsahovala některé z nejnovějších inovací v technologii superpočítače.