Den første supercomputer i Indonesien er Y-MP Cray, der ejes af Lipi i 1992.
På nuværende tidspunkt er den hurtigste supercomputer i Indonesien Agarwood betjent af BPPT med en spidshastighed på 1,5 petaflop.
Indonesien har adskillige andre supercomputere, såsom Terascale Computing System (TCS) og HPC-UGM.
Supercomputere bruges på mange områder i Indonesien, herunder videnskabelig forskning, vejrmodellering og forudsigelser af naturkatastrofer.
Indonesien har et nationalt program til at udvikle supercomputere og relateret teknologi, kendt som National Supercomputer Technology Research and Innovation Program (PRISM).
Supercomputer fremstillet i Indonesien, ved navn Merah Putih, blev lanceret i 2018 og forventes at øge den indonesiske teknologis konkurrenceevne.
Supercomputere bruges også til at udvikle kunstige intelligensapplikationer og automatiseringsteknologi i Indonesien.
BPPT er en regeringsinstitution, der er ansvarlig for driften af flere supercomputere i Indonesien.
En række universiteter i Indonesien har også deres egne supercomputere, herunder Gadjah Mada University og Bandung Institute of Technology.
Indonesien var vært for Asien-Pacific-konferencen om Super Computers i 2018, som indeholdt nogle af de nyeste innovationer inden for supercomputerteknologi.