Ο πρώτος σούπερ υπολογιστής στην Ινδονησία είναι το Cray Y-MP που ανήκει στο Lipi το 1992.
Επί του παρόντος, ο ταχύτερος υπερυπολογιστής στην Ινδονησία είναι το Agarwood που λειτουργεί από την BPPT με ταχύτητα μέγιστης 1,5 Petaflop.
Η Ινδονησία διαθέτει αρκετούς άλλους υπερυπολογιστές όπως το Terascale Computing System (TCS) και το HPC-UGM.
Οι υπερυπολογιστές χρησιμοποιούνται σε πολλούς τομείς στην Ινδονησία, συμπεριλαμβανομένης της επιστημονικής έρευνας, της μοντελοποίησης των καιρικών συνθηκών και των προβλέψεων φυσικών καταστροφών.
Η Ινδονησία διαθέτει ένα εθνικό πρόγραμμα για την ανάπτυξη υπερυπολογιστών και σχετικής τεχνολογίας, γνωστή ως Εθνικό Πρόγραμμα Έρευνας και Καινοτομίας της Εθνικής Υπηρεσίας Supercomputer Technology (PRISM).
Ο υπερυπολογιστής που κατασκευάστηκε στην Ινδονησία, που ονομάστηκε Merah Putih, ξεκίνησε το 2018 και αναμένεται να αυξήσει την ανταγωνιστικότητα της ινδονησιακής τεχνολογίας.
Οι υπερυπολογιστές χρησιμοποιούνται επίσης για την ανάπτυξη εφαρμογών τεχνητής νοημοσύνης και τεχνολογίας αυτοματισμού στην Ινδονησία.
Το BPPT είναι κυβερνητικός θεσμός που είναι υπεύθυνος για τη λειτουργία πολλών υπερυπολογιστών στην Ινδονησία.
Ορισμένα πανεπιστήμια στην Ινδονησία έχουν επίσης τους δικούς τους υπερυπολογιστές, όπως το Πανεπιστήμιο Gadjah Mada και το Ινστιτούτο Τεχνολογίας Bandung.
Η Ινδονησία φιλοξένησε το συνέδριο της Ασίας-Ειρηνικού για τους Super Computers το 2018, το οποίο περιελάμβανε μερικές από τις τελευταίες καινοτομίες στην τεχνολογία υπερυπολογιστών.