Pierwszym super komputerem w Indonezji jest Cray Y-MP należąca do LIPI w 1992 roku.
Obecnie najszybszym superkomputerem w Indonezji jest agar z BPPT o szczytowej prędkości 1,5 Petaflopa.
Indonezja ma kilka innych superkomputerów, takich jak system obliczeniowy Terascale (TCS) i HPC-UGM.
Superkomputery są stosowane w wielu dziedzinach w Indonezji, w tym w badaniach naukowych, modelowaniu pogodowym i prognozach klęsk żywiołowych.
Indonezja ma krajowy program opracowywania superkomputerów i powiązanej technologii, znanej jako National Superkomputer Technology Research and Innovation Program (PRISM).
Superkomputer wyprodukowany w Indonezji, o imieniu Merah Putih, został wydany w 2018 r. I oczekuje się, że zwiększy konkurencyjność technologii indonezyjskiej.
Superkomputery są również wykorzystywane do opracowania aplikacji sztucznej inteligencji i technologii automatyzacji w Indonezji.
BPPT jest instytucją rządową odpowiedzialną za działanie kilku superkomputerów w Indonezji.
Wiele uniwersytetów w Indonezji ma również własnych superkomputerów, w tym Uniwersytet Gadjah Mada i Bandung Institute of Technology.
Indonezja była gospodarzem konferencji Azji i Pacyfiku na temat Super Computers w 2018 r., Która zawierała niektóre z najnowszych innowacji w technologii Superkomputer.