Endonezya'daki ilk süper bilgisayar, 1992'de LIPI'nin sahip olduğu Y-MP Cray'dir.
Şu anda, Endonezya'daki en hızlı süper bilgisayar, BPPT tarafından 1.5 petaflop tepe hızına sahip Agarwood'dur.
Endonezya'nın Terascale Computing Sistemi (TCS) ve HPC-UGM gibi birkaç süper bilgisayar vardır.
Süper bilgisayarlar, Endonezya'daki birçok alanda bilimsel araştırma, hava modellemesi ve doğal afetlerin tahminleri dahil olmak üzere kullanılmaktadır.
Endonezya, Ulusal Süper Bilgisayar Teknolojisi Araştırma ve İnovasyon Programı (PRISM) olarak bilinen süper bilgisayar ve ilgili teknolojiler geliştirmek için ulusal bir programa sahiptir.
Merah Putih adlı Endonezya'da yapılan süper bilgisayar 2018'de piyasaya sürüldü ve Endonezya teknolojisinin rekabet gücünü artırması bekleniyor.
Süper bilgisayarlar, Endonezya'da yapay zeka uygulamaları ve otomasyon teknolojisi geliştirmek için de kullanılır.
BPPT, Endonezya'daki birkaç süper bilgisayarın işletilmesinden sorumlu bir devlet kurumudur.
Endonezya'daki bazı üniversitelerin Gadjah Mada Üniversitesi ve Bandung Teknoloji Enstitüsü de dahil olmak üzere kendi süper bilgisayarları da vardır.
Endonezya, 2018 yılında SuperComputer Technology'deki en son yeniliklerden bazılarını içeren Asya-Pasifik Süper Bilgisayarlar Konferansı'na ev sahipliği yaptı.