كان اكتشاف أحافير Pithecanthropus erectus في ترينيل ، شرق جاوة في عام 1891 أحد أهم الاختراعات في التاريخ البيولوجي في إندونيسيا.
في ثلاثينيات القرن العشرين ، تمكن عالم النبات يدعى Soejatmi Tjitrosomo من العثور على أنواع نباتية جديدة تم تسميتها لاحقًا Nepenthes Djamban.
في عام 1961 ، تمكن عالم الأحياء يدعى Soedjito Soemodihardjo من العثور على نوع أسماك جديد في بحيرة Toba تم تسميته لاحقًا Toba.
في عام 1978 ، تمكنت دراسة للتنوع البيولوجي في حديقة لورنتز الوطنية ، بابوا ، من العثور على أنواع جديدة من الطيور تدعى Cicinnurus Lorentzi.
في عام 1981 ، تمكن عالم الأحياء البحرية يدعى يوليوس بوروانتو من العثور على نوع أسماك جديد في مياه لومبوك والذي تم تسميته لاحقًا Pseudanthias Lombokensis.
في عام 1993 ، تمكن عالم الأحياء يدعى Djaja Doel Soejarto من العثور على مركبات كيميائية جديدة من النباتات التي تم استخدامها بعد ذلك كمكونات طبية لعلاج السرطان.
في عام 2001 ، تمكن عالم الأحياء البحري يدعى جمال الدين جومبا من العثور على نوع جديد من الشعاب المرجانية في مياه واكاتوبي ، جنوب شرق سولاويزي.
في عام 2006 ، تمكن عالم الأحياء الجزيئي يدعى Herawati Sudoyo من العثور على اختلافات وراثية في البشر في إندونيسيا التي تختلف عن الوراثة البشرية خارج إندونيسيا.
في عام 2010 ، تمكنت دراسة للتنوع البيولوجي في حديقة غونونج ليوزر الوطنية ، سومطرة ، من العثور على أنواع جديدة من الطيور تدعى Zoothera Salimalii.
في عام 2015 ، تمكن عالم الأحياء البحرية يدعى Fitry Pakiding من العثور على أنواع قناديل جديدة في مياه Bunaken ، North Sulawesi والتي تم تسميتها لاحقًا Euphysa Bunakenensis.
